La Pontificia Universidad de la Santa Cruz es una institución erigida por la Santa Sede, para la enseñanza y para la investigación en las ciencias eclesiásticas. Actualmente, está constituida por las facultades de Teologia, Derecho Canónico, Filosofía, Comunicación Social Institucional y por el Instituto Superior de Ciencias Religiosas all'Apollinare.

Las facultades ofrecen los tres ciclos de estudios universitarios, y otorgan los titulos de bachiller, licenciado y doctor. Los cursos de bachillerato en Filosofía y en Teología proporcionan la preparación académica necesaria previa al sacerdocio. El Instituto Superior de Ciencias Religiosas es un centro de educación a distancia que habilita para la enseñanza de la religión en las escuelas italianas, públicas y privadas, en todos los niveles escolares.

La actividad docente se dirige a favorecer y perfeccionar la capacidad de reflexión, el espíritu de iniciativa y el sentido de responsabilidad en el estudio y en la investigación científica. Desea responder a la peticién del Santo Padre Juan Pablo II: «quienes tienen la responsabilidad de la formación sacerdotal, tanto académica como pastoral... cuiden con particular atención la preparación... de los que habrán de anunciar el Evangelio al hombre de hoy y, sobre todo, de quienes se dedicarán al estudio y a la enseñanza de la Teología.

No se olvide la grave responsabilidad de una previa y adecuada preparación de los profesores destinados a la enseñanza... en los Seminarios y en las Facultades eclesiásticas. Es necesario que esta enseñanza esté acompañada de la conveniente preparación científica, que se ofrezca de manera sistemática... y que se realice con el debido discernimiento ante las exigencies actuales de la Iglesia y del mundo (Enc. Fides et ratio, n. 105).

La Universidad está promovida por la Prelatura de la Santa Cruz y Opus Dei. Tiene su origen en el proyecto de San Josemaría Escrivá, Fundador del Opus Dei, de crear en Roma un centro de enseñanza al servicio de toda la Iglesia.

Su sucesor, Mons. Alvaro del Portillo, pudo llevar a la práctica esta iniciativa y comenzar en 1984 las actividades académicas.

La Pontificia Universidad de la Santa Cruz, ha sido erigida por la Congregación para la Educación Católica con decreto del 9 de enero de 1990 y ha sido confiada a la Prelatura personal de la Santa Cruz y Opus Dei. Su Gran Canciller es el Prelado del Opus Dei, Mons Javier Echevarría.